EMSA( 凝胶迁移或电泳迁移率实验)实验：

EMSA 是—种用于研究核酸和蛋白质之间相互作用的技术，适用于转录因子与启动子相互作用的验证性实验，主要是验证蛋白质与特定核酸序列的结合特性，从而间接推断巳知蛋白质的靶序列或已知序列的结合蛋白质分子。

CHIP (染色质免疫共沉淀)实验：

CHIP 是目前唯—研究体内DNA 与蛋白质相互作用的方法，它不仅可以检测体内反式作用因子与DNA 的相互作用，还可以用来研究组蛋白的各种共价修饰与基因表达关系。

CHIP: 充分反映生理条件下DNA 与蛋白质相互作用的真实情况，可以找出生理条件下某个DNA 结合蛋白与DNA 序列的结合位点，从而反映体内基因表达调控的真实情况。